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Modulhandbuch Master Medizinische Informatik ab WS 2014/15

Modul CS5460-KP05

Analyse von Hochdurchsatzdaten (AnaHDD)

Dauer:


1 Semester
Angebotsturnus:


Jedes Wintersemester
Leistungspunkte:


5
Studiengang, Fachgebiet und Fachsemester:
  • Master Medizinische Informatik 2014 (Wahlpflicht), Bioinformatik, 1. oder 2. Fachsemester
Lehrveranstaltungen:
  • CS5460-Ü: Analyse von Hochdurchsatzdaten (Übung, 2 SWS)
  • CS5460-V: Analyse von Hochdurchsatzdaten (Vorlesung, 2 SWS)
Workload:
  • 60 Stunden Präsenzstudium
  • 70 Stunden Selbststudium
  • 20 Stunden Prüfungsvorbereitung
Lehrinhalte:
  • Methodische und statistische Grundlagen von Hochdurchsatzsequenzierung
  • Sequenziermethoden: RNA-seq, ChIP-seq, Whole Genome Sequencing, Whole Exome Sequencing
  • Datenqualität beurteilen
  • Öffentliche Datenbanken zur Annotation und Analyse nutzen
  • Analysemethoden zur personalisierten Medizin
Qualifikationsziele/Kompetenzen:
  • Die Studierenden können Hochdurchsatzsequenzierung von traditioneller Sanger Sequenzierung abgrenzen.
  • Die Studierenden können die wichtigsten Entwicklungen wiedergeben (zeitliche Einordnung).
  • Die Studierenden können Verfahren zur Hochdurchsatzdatensequenzierung inhaltlich beschreiben, sowie Unterschiede zwischen den Methoden aufzeigen.
  • Die Studierenden haben Methodenkompetenz erworben, d.h. sie sind in der Lage Hochdurchsatzdaten auszuwerten und biologisch zu annotieren und einzuordnen. Dazu gehört, Methoden oder Software zu benennen, um spezifische Datensätze zu analysieren und zu modellieren.
  • Die Studierenden können Hochdurchsatzdaten aus öffentlichen Datenbank nutzen und ihre eigenen Projekte integrieren.
Vergabe von Leistungspunkten und Benotung durch:
  • Klausur oder mündliche Prüfung nach Maßgabe des Dozenten
Modulverantwortlicher:
Lehrende:
Literatur:
  • Wing-Kin Sung: Algorithms for Next-Generation Sequencing - CRC Press, 18 May 2017
  • Datta, Somnath, Nettleton, Dan (Eds.): Statistical Analysis of Next Generation Sequencing Data - Springer, Heidelberg, 2014
Sprache:
  • Sowohl Deutsch- wie Englischkenntnisse nötig
Bemerkungen:

Zulassungsvoraussetzungen zur Belegung des Moduls:
- Keine

Zulassungsvoraussetzungen zur Teilnahme an Modul-Prüfung(en):
- keine

Modulprüfung(en):
- CS5460-L1: Analyse von Hochdurchsatzdaten, mündliche Prüfung, 100% der Modulnote

Letzte Änderung:
19.8.2021